杭州圆通货运航空有限公司成立于2014年9月，是上海圆通蛟龙投资发展(集团)有限公司筹建的货运航空公司，其主基地设在杭州萧山国际机场，行政办公总部位于萧山国际机场空港大道。
杭州圆通货运航空有限公司(以下简称圆通航空)为上海圆通蛟龙投资发展(集团)有限公司(以下简称圆通集团)筹建的货运航空公司，其主基地设在杭州萧山国际机场，行政办公总部位于萧山国际机场空港大道。成立于2014年9月，注册资本为40000万元人民币。
2022年1月14日，作为2022年杭州亚运会官方物流服务赞助商，圆通速递积极参与亚运、服务亚运、宣传亚运，圆通航空首架波音B767-300ERF宽体货机飞抵杭州，在为杭州亚运会提供充分的运能保障的同时，还将积极打造成为推介和传播杭州亚运会的“空中名片”。
2022年7月12日，圆通航空首航“昆明—德里”。
2022年7月25日，圆通航空集团创新总部项目签约仪式在秀洲区会展中心举行。
2022年9月消息，杭州圆通货运航空有限公司通过在东疆综保区设立的租赁公司完成一架货运飞机引进，并以保税租赁的方式交付至圆通航空。