B2B医药电商系统指借助互联网渠道进行药品销售及服务的商业模式，包括药品生产或经营企业、各类服务商等通过互联网渠道，进行医药产品交换及提供相关服务的系统。
系统优势1、数据完整性：大数据时代，电商平台因为有完整的用户行为数据、交易数据，就可以针对性进行营销和推广，所以电商模式比传统的交易模式有更大的无形价值。而第三方平台都只是提供了部分数据给企业，而且很多时候，需要更多数据都是要另外付费。自建医药电商系统，拥有所有数据，包括“用户的浏览习惯”“用户的交易习惯”“商品的表现”“交易量的趋势”等数据。都是企业自有数据，可以针对性做出营销推广。
2、数据安全性：医药企业进驻第三方平台，在上面的交易数据，理论上就属于第三方平台所有，不受法律的保护，我们都知道，国内最大的电商平台，他们有个“生意参谋”的工具，只要付费，就可以用这个工具，看到其他对手的数据。反过来，我们在上面的交易数据，也能被对手轻易看到。这样就相当于在第三方平台上“裸奔”。自建医药电商系统，企业是在自己的服务器上部署自己的电商软件，那么产生的数据，都是受法律保护的，即使被黑客入侵，也是可以报案寻求法律保护。
3、低费用：第三方平台，前期低价，后面涨价。国内某最大的电商平台，给我们上了很生动一课，前三年免费，后续拼命收费，推出各种广告工具，如果不付费，根本没有流量，更别提有交易。自建医药电商系统，属于一次性买断，后续只需收取比较低的产品升级和技术维护费。
4、可持续的经营：第三方平台的竞争也是非常激烈，一旦他们经营失败，进驻的企业的所有数据（客户、订单、销售数据）也无法再进行访问或查询，而且迁移客户是一个风险很大的事情，将导致客户大量流失。自建医药电商系统，属于自己所有，不必依赖第三方平台的经营周期，不担心受第三方平台所影响。
5、自由拓展市场区域：企业进驻第三方平台，在经营的区域范围上，受第三方平台所控制，对进驻的企业进行一定的区域范围管控，从而无法自主掌控整个经营范围。自建医药电商系统，对经营区域范围的控制完全操控在企业自己手上。
6、数字资产清晰：例如互联网的域名，等同是我们企业的名片、地址，一旦使用，客户会形成一个路径依赖，如果更改的话，很容易造成客户流失。跟第三方平台合作，域名归他们所有，一旦脱离第三方，则客户已经形成域名的依赖，很难把之前的老客户迁移到新的域名，容易导致客户流失。自建医药电商系统，域名是自己所有，只要按时续费，不用担心域名的归属问题。
7、提升企业运作效率：例如，与ERP系统的深度对接，带来从前端销售到后端作业的更高效率。第三方平台，与ERP对接时，只对接了部分基础信息和订单信息，还无法做完全对接。自建医药电商系统，与ERP是完全对接，包括会员等级价格、积分、信贷额度、应收款数据、商品库存及批号数据、业务员资料、物流（包括退货）信息、资金结算数据等，接口是完全开放的。
8、形成私域流量池：在第三方平台，客户随时面临被引流的风险，毕竟都是在打价格战。自建医药电商系统，是企业的独立自主系统，完全自主拥有，不担心会有被私下引流的风险。