货代提单和船东提单都是提单的一种方式，他们都是属于海运提单的范畴, 不过两者之间还是有细微的差别。那么货代提单与船东提单的区别是怎样的呢?
1、签发的主体不一样
MB/L是船公司签发的提单，而HB/L是货代基于MB/L出的提单，由货代公司签发。 货代单不是想签发就签发，签发货代单的主体起码要在目的港有代理。
2、抬头不一样
船公司提单是以船公司为抬头的,货代提单是以货代名称为抬头的。
3、目的港收货方式不同
船东单可以直接向船公司提货，货代单提货时必须先在目的港向货代的代理换取船公司提单。然后再凭着船公司提单去提货,俗称换单。或者由目的港客户凭货代单直接找货代的代理提货。
4、适用范围不一样
船东单适用于FCL货物，LCL货物，货代只能给客户签发货代单，或者电放。因为船公司是不会帮你拼箱的，到目的港也不会帮你分货。这种情况只能出HB/L或者电放。
或许有人会问，既然船公司可以出提单，那么为什么还要有一个货代单呢? 原因在于：虽然说船东单(MB/L)是最基本的物权凭证，但是死板，里面的许多条款你无法左右。如果你是做L/C的，但是你在规定的交货期生产不出来，上不了船，那么你可以选择出HB/L，并且要求货代帮你倒签提单。假如你做L/C的，审单的时候你没有发现里面对船的特殊要求(如：船龄，船籍，ISM CODE，运费证明，挂靠港口，船证等等)而船公司又不能出具这些，不按要求交单，无法结汇，在L/C没有明确规定不接受货代单的情况下，SHIPPER一般会选择出货代单，此种做法一般国外客户不太容易接受。
另外，在发货方没有收到国外客户的货款的时候，有可能会要求签发货代单以便控制货物，避免钱货两空。
还有一种比较特殊的情况：牵涉到第三方，中间商不想让最终的客户知道货物的来源等其他信息，就有可能要求签发货代单，以达到保护商业秘密的目的。这样做产生的风险是：签发船东单对发货人和货代来说都是比较安全的选择。对发货人来讲船东的信誉和安全系数高于货代，对货代来说也比较安全;所以整柜出口不到万不得以货代不是很愿意签发货代单。
5、费用不一样
船东单目的港提货一般不会产生什么费用，货代单提货肯定会收取目的港客户的换单费，也有可能由发货人支付给货代，货代另行和代理结算。
相对来说，货代提单是由货运代理签发的提单价格相对比较便宜，但是有风险，到目的港不知道会不会多收什么费用。 而船东单就是由船公司签发的，价格相对贵，但风险小，目的港一般都不会多收费用!