包机运输和包舱运输都是航空货物运输的方式，它们之间的主要区别在于运输的独立性和灵活性。
1. 独立性：
包机运输是指托运人包用整个飞机进行货物运输，托运人在一定时间内可以独立使用飞机的载货空间。这种方式具有较高的独立性，托运人可以更好地控制货物的运输过程。
包舱运输是指托运人与航空公司达成协议，在一定时间内拥有飞机固定的仓位。与包机运输相比，包舱运输的独立性较低，因为托运人需要与其他托运人共享飞机的载货空间。
2. 灵活性：
包机运输的灵活性较高，托运人可以根据自身的需求选择合适的飞机型号和航班时间。同时，包机运输可以更好地满足托运人对货物运输的特殊要求，如运输时间、运输条件等。
包舱运输的灵活性相对较低，托运人需要在航空公司提供的航班时间和飞机型号范围内进行选择。虽然包舱运输的灵活性较低，但其成本相对较低，因为托运人可以与其他托运人共享飞机的载货空间，降低单件货物的运输成本。
总结来说，包机运输具有较高的独立性和灵活性，但成本相对较高;而包舱运输的独立性和灵活性较低，但成本相对较低。托运人可以根据自身的需求和经济条件选择合适的运输方式。