随着海南自贸港建设的推进，跨境电商发展迅猛。对于跨境电商企业来说，物流是关键性的命脉。数据显示，海口跨境电商企业如今已达600余家。跨境电商企业的入驻，随之而来的是物流企业也大批进入海南自贸港。
顺丰、圆通、邮政、京东、菜鸟，这几大物流巨头均已进驻海口江东新区。为了打造国际物流中心，海口综保区制定跨境电商专项扶持政策，主要从销售额、物流补贴、仓储服务等方面吸引国内知名电商企业，降低物流成本。
除以上知名物流企业外，更有许多中小型物流企业或扎根或开设分部办公室于海口。
一、NX
NX（NIPPON EXPRESS）的前身是日本通运，其创建可以追溯到1872年，是日本的综合性物流企业。自1981年进入中国市场，NX中国已经有超过40年的发展历史，先后建立了以北京、上海、广州为中心的华北东北、华东华中、华南三个主要业务区域，由沿海到内陆、由内陆向西部逐渐延伸和发展，已经形成了辐射全国重要运输枢纽的战略格局。
为了加强NX品牌在海南的影响力，以及扩大中国市场的业务规模，开拓商机，今年7月，NX中国在海南设立了事务所。
二、海程邦达
海程邦达成立于1996年，是国内领先的国际供应链物流商之一。2020年，海程邦达注册海南子公司，开通香港-三亚国际货运定期包机航线；2021年，又开通米兰-海口国际航线；2022年，在已开通航线稳定运营基础上，新增开通悉尼-海口国际货运定期包机航线。开拓海南市场也让海程邦达获得了新的增长点，海程邦达行业解决方案事业部总监黎嘉仪表示，在中西部市场，海程邦达的强项主要在高科技行业，而海南市场帮助公司开拓了在消费零售行业的更多可能性。
三、嘉里物流
嘉里物流（股票代码 0636.HK）是一家以亚洲为基地的国际第三方物流服务供应商，为跨国企业及国际品牌提供端对端的供应链解决方案，满足客户由采购、生产以至环球销售的需要。总部设于香港，环球网络遍及六大洲60个国家及地区，于大中华及东盟地区拥有庞大的配送网络和物流枢纽。
嘉里物流是首家在海口综保区投资建设保税物流中心的国际第三方物流企业，该物流中心面积约5万平方米，提供保税仓储及增值服务：装卸、存储、包装、盘点、贴标、分拣、理货等。
四、卓志集团
卓志集团是位于广东的国内知名跨境电商供应链服务公司。2020年6月1日 《海南自由贸易港建设总体方案》发布后，卓志是第一批考察并落户海南洋浦的外贸服务型平台企业，与洋浦管委会就卓志洋浦全球优品分拨中心这一海南自贸港重点项目完成签约，后在洋浦设立了占地三层共计12000㎡的保税仓，并于同年10月完成首批货物进口以及洋浦跨境电商首单测试。
五、海南森通仓储物流有限公司
森大集团控股子公司，注册于海南自由贸易港，致力于为企业打通线上线下销售过程中的仓储与物流、快递配送一体化的运作模式，是森大集团投资项目森免万国购全球商品展示交易中心的核心功能。一期仓库位于海南省澄迈县老城经济开发区南一环路69号海口综合保税区A-08地块A1栋一楼A1 01- 02仓库 ，面积规划3万平方，目前已收购合并海南大拇哥等优质仓储企业，在仓企业已服务50余家，货物存储总量30余万件，日平均出单量1000余票，最高日出单量可达20000票。