独立小程序和平台小程序的主要区别如下：
1、申请注册和认证方式：独立小程序需要商家自行申请注册并完成认证，过程可能较为繁琐，需要提供营业执照等主体资料，并每年支付一定的认证费用。而平台小程序，商家无需注册小程序，可直接使用锐宜会员管理系统，且系统操作简单。
2、名称唯一性：独立小程序名称具有唯一性，顾客关注后显示的是对应的唯一名称。而平台小程序在设置时可以自行设定名称，对于部分商家名称重复的问题也可以接受。
3、操作便利性：平台小程序使用电脑进行设置，为需要处理大量数据的用户提供了便利。而独立小程序则无法与公众账号进行关联，无法通过搜索商家名找到小程序，这点可能为商家的运营带来一定的不便。
独立小程序拥有更多的自主性和唯一性，但申请和操作可能相对复杂；而平台小程序虽然无需注册，操作简单，但可能存在名称重复等问题。商家可以根据自己的实际需求和情况来选择合适的小程序类型。