由于农业所具有的特殊的自然属性，导致了农产品供应链存在资产专用性高、物流要求高以及市场不确定性较大等几个特点。因此，针对中国的现实状况提出如下主要的农产品供应链管理模式。
1.以龙头加工企业为核心的供应链管理模式。在中国农产品供应链系统中。农民生产者是最薄弱一环。由于广大的农户是分散经营的，农户组织化程度低，在供应链中处于不对称的弱势地位。因而可以通过以加工企业为核心，通过龙头企业的规划、指导、协调来提高农民的组织化程度。保证生产活动的稳定性。在资金技术和生产资料等方面由公司为农户提供支持，减少农户的市场风险。这样同时还能使农产品加工企业在原料的供应上得到保证，形成规模经营。获得规模报酬。不仅能够降低生产成本而且还能够降低供应链的内部交易成本。这种模式具体可采取"公司+基地+农户"模式，加工企业与农户一般可以通过契约来规定双方权利和义务。这样加工企业成为了供应链上核心节点的位置.供应链管理的主要任务就由农产品加工企业来承担.供应链成功的关键取决于加工企业的素质。这就要求企业不断提高自身的管理水平，要从事种子开发等技术研究和推广.以及农产品收购和仓储等复杂问题，这种物流职能的内部化， 如果不能有效地进行科学管理。很容易造成规模不经济。
2.以物流中心为核心的供应链管理模式。由于农产品种类的不同和以往农产品流通的惯性。中国农产品又是分散的农户经营，使得农产品加工企业的原材料供应时间、质量、品种的得不到保证。我们可以通过在供应链上的"零散的代收点" 和"加工企业" 两个节点之间加上一个物流中心，通过建立农产品物流中心完成供应链系统整合，把农民生产的分散的农产品集中到物流中心。然后由物流中心再统一配送到各农产品加工企业。通过配送中心还可以对农产品的数量、质量、品种进行管理。此外，有一些生鲜农产品可以通过构建加工物流一体化的物流中心，实现农产品的快速高效配送，减少流通环节，提高农产品的新鲜度与质量。由于物流中心一般具有较大的规模与物流能力.一般可以同时为多个上游环节及下游环节提供物流服务。物流中心可通过对批发市场的改造发展而来，采用先进的电子信息技术辅助农产品交易，配备完善的物流体系和信息平台，使得物流中心成为连接生产、加工、零售的核心环节。
没有一种模式可以适应任何地方.因地制宜是需要坚持的主要观点。用市场经济的规律引导农民进入产业化。以各类大大小小的龙头企业、农民专业协会构建农产品的复合供应网链是探索的方向。