跨境供应链系统主要涵盖物流、资金流方面，包括了供应商、物流以及海关。随着各个国家针对跨境电商网站企业的相关政策完善优化，在资本的支持下，跨境市场机遇增加的同时竞争也在日趋激烈，所以做好跨境电商供应链服务需要具备：强大的海外商品组织、货源整合能力，在其他国家拥有有效的转化能力，擅长跨境平台运营以及跨境电商供应链流程管控能力。
一、跨境供应链系统可以分为几种模式：1、M2C跨境电商供应链模式：电商平台招商，这一类的典型玩家如天猫国际，开放平台入驻国际品牌。
2、B2C跨境电商供应链模式：保税自营+直采，这一类的典型玩家如考拉海淘，目前此模式还是以爆品标品为主。
3、C2C跨境电商供应链模式：海外买手制，典型玩家如洋码头，海外买手（个人代购）入驻跨境电商平台开店，从品类来讲以长尾非标品为主。
4、B2B2C跨境电商供应链保税区模式：跨境供应链服务商通过保税进行邮出模式，与跨境电商平台合作为其供货，平台提供用户订单后由这些服务商直接发货给用户。
5、海外跨境电商供应链直邮模式：典型玩家是亚马逊，返利导购/代运营模式 ，内容分享/社区资讯，典型玩家如小红书，内容引导消费，自然转化。
二. 普通跨境电商不同于跨境供应链系统的难点分析1、各个国家的跨境电商政策对于各种跨境电商品类的海淘物品的税收和政策，各级政府都还在探索中，会很大程度上影响海淘物品最终的价格，从而影响到消费者的购买决策。
2、跨境电商系统物流与售后海淘运输涉及到了海外物流及报关报税，大部分不支持售后退换货。
3、跨境电商供应链爆品仍占跨境海淘很大比例，但海外爆品品牌商供货渠道不稳定，与国内跨境电商供应链平台直接签约合作可能性小，跨境电商供应链平台为保证爆品供货通常采用复合渠道，价格难以控制，毛利趋近于0。但即便如此，部分跨境电商平台仍旧时常断货无货。而且，其中的跨境供应链长，环节复杂，各地区文化和商业环境有差异，打通各环节难度大。
三、跨境供应链系统内容痛点分析跨境电商供应链管理（Supply Chain Management ，简称SCM）：就是指在满足一定的客户服务水平的条件下，为了使整个跨境电商供应链系统成本达到最小而把供应商、制造商、仓库、配送中心和渠道商等有效地组织在一起来进行的产品制造、转运、分销及销售的管理方法。跨境电商供应链系统管理包括计划、采购、制造、配送、退货五大基本内容，在跨境电商这里，跨境电商供应链系统的难点主要集中在计划、采购、配送和退货这四大方面。
（1）跨境电商计划：跨境电商供应链计划指的是建立一系列的方法监控供应链，使它能够有效、低成本地为顾客递送高质量和高价值的产品或服务。
（2）跨境平台采购：跨境平台选择提供货品和服务的供应商，和供应商建立一套定价、配送和付款流程并创造方法监控和改善管理，并把对跨境电商供应商提供的货品和服务的管理流程结合起来，包括提货、核实货单、转送货物到你的制造部门并批准对供应商的付款等。
（3）跨境网站配送：即物流，是调整用户的定单收据、建立仓库网络、派递送人员提货并送货到顾客手中、建立货品计价系统、接收付款。
（4）跨境商城退货：这是跨境电商供应链中的问题处理部分，建立网络接收客户退回的次品和多余产品，并在客户应用产品出问题时提供支持。
四、跨境供应链系统运营发展受限制的外部痛点原因1、跨境电商报税体系不成熟跨境电商平台单个订单商品数量少、客单金额小、频次高，使得海关监管难度加大，报关报检尚不成熟，国家法律层面的相关政策尚在不断探索过程中，商检、结汇及退税都存在相应的问题，跨境电商供应链售后体验很难得到保障。
2、跨境平台模式重供应链长受国际跨境电商供应链采购与物流限制，跨境电商平台模式重，跨境供应链长。正常清关的情况下，发货给消费者需要2~25天。如果当次消费产生退款，那么这时候整个流程的周期就加倍变长。
通常，大多数国内的跨境电商网站公司选择自建保税仓或者是海外仓，各种进出仓、报损、调度、退货等等，对跨境供应链系统和库管人员的管理要求较高。
3、跨境网站政策征税影响大政策对海淘商品的最终价格影响之大毋庸置疑。
以“四八新政”为例，新政实施后，进口商品按“货物”标准征税，取消 50 元免征点，门槛上浮，行邮税大幅上涨，化妆品类商品税率上调至50%。其次，个人海淘商品受限，每人每天最多5单，每单限量5件，限额2000，个人年度交易限值20000。直接导致保税区优势不再，而中小跨境电商网站企业由于很难自建跨境电商供应链系统，面临生存危机。
4、跨境商城货品采购合作难跨境商城货品采购需要先确定提供货品和服务的供应商，然后和跨境平台供应商建立一套定价、配送和付款流程，将供应商提供的货品和服务同时进行监控和改善。如提货、核实货单、转送货物、对供应商的付款等环节，但商品品控管理无论是买手模式，还是品牌商合作模式，都有容易跌落的“坑”。