跨境电商流程包含线上展示，完成支付后进行投递，经过海关后由物流派送至买家手中。
跨境电商出口的流程大体为：出口商生产商将商品通过跨境电子商务企业(平台式/自营式)进行线上展示，在商品被选购下单并完成支付后，跨境电子商务企业将商品交付给境内物流企业进行投递，经过出口国和进口国的海关通关商检后，最终经由境外物流企业送达消费者或企业手中，从而完成整个跨境电商交易过程。
在实际操作中，有的跨境电商企业直接与第三方综合服务平台合作，让第三方综合服务平台代办物流、通关商检等一系列环节的手续。也有的跨境电商企业通过设置海外仓等方法简化跨境戴安上部分环节的操作，但其流程扔不脱如上框架。
跨境电商进口的流程除方向与出口流程的相反外，其他内容基本相同。
可见，跨境电商兼具一般电子商务和传统国际贸易的双重特性，其贸易流程比一般电商贸易流程要复杂的多，它涉及国际运输、进出口通关、国际支付与结算等多重环节，也比传统国际贸易更需考虑国际展示和运营的电子商务特性。跨境电商在国际贸易领域也发挥着越来越重要的作用。