药品行业具备一定的特殊性质，所以医药管理软件不同于普通商品百货，对经销商的资质、物流配送、仓储资质、相关证件、药品溯源等方面具有严格的管理标准。药品行业供应链管理系统是集进、销、存以及财务一体化专业药店管理软件，不仅要满足日常办公要求，对企业内部的管理更加规范化。
药业企业在市场经营活动中，对各经销商合同协议的签订、销售区域、样品申请、资料申请、营销资料申请、发货订单、代垫费用支付等各个环节的过程管理，可以实现全流程线上数据共享，方便后期对各经销商的维护和业务拓展。
经销商物流配送环节可以实现一物一码、货品溯源，对应每一批号、产品序列号防止窜货和后期的货物追踪，同时可以实现物流配送方式和储运条件等相关信息的记录。包括对出库的分类，销售出库、样品出库、采购入库、退换货出入库等，对库存的日常盘点、库存下限预警、盈亏平衡、货物破损等日常记录。
在药品供应链管理系统中对日常的采购流程管理，可以实现对供应商管理、采购申请单、采购询价比价、采购订单、采购明细，相关数据的统计分析，为管理人员提供决策分析依据的来源。
财务对一家企业来说是重点需要管理的部分，药品药品供应链管理系统中可以实现应收应付往来对账单、经销返款台账、费用结算的功能。以实现采购计划、订单寻源、物流发货、财务结算的一体化管理综合管理系统。